%0 Journal Article
%A 陈世龙
%A 宋相杰
%A 王久利
%A 邢睿
%A 张发起
%A 朱明星
%T 椭圆叶花锚简化基因组的SSR信息分析及SSR引物开发
%D 2018
%R 10.7525/j.issn.1673-5102.2018.02.018
%J 植物研究
%P 292-297
%V 38
%N 2
%X 基于RAD-seq简化基因组测序技术获得椭圆叶花锚（<em>Halenia ellipitica</em> D.Don）简化基因组水平上的序列信息并开发SSR分子标记。利用SR search软件检测而得到双端各有至少100 bp的五种类型的SSR（二、三、四、五、六核苷酸）位点共6 201个，并成功设计其中3 865个SSR引物。在能成功设计引物的SSR位点中，三核苷酸SSR位点最多；重复序列长度包括17种（12~36 bp）；重复序列的基序共达316种，其中五核苷酸基序种类最多（91种）。从中挑选65对可对应五种SSR类型的引物，经梯度PCR检验后，利用椭圆叶花锚的4个居群32个个对可扩增的引物进行PCR和聚丙烯酰氨凝胶电泳检测，其中14对引物能在绝大多数个体中扩增，且13对具多态性。13个多态性位点的等位基因数量均值为5.462，多态性较高且不连锁（<em>P</em>&lt;0.05）；其中10个位点在多数居群中偏离哈迪温伯格平衡（<em>P</em>&lt;0.01）且存在较高的纯合子数量（观测杂合度<em>H</em><sub>o</sub>均值0.226）；近交系数在-0.443~1，均值为0.656；基因流<em>N</em><sub>m</sub>为0.474。
%U https://bbr.nefu.edu.cn/CN/10.7525/j.issn.1673-5102.2018.02.018